Abstract
Protein biosynthesis, or translation, occurs on the ribosome, a large RNA-protein assembly universally conserved in all forms of life. Over the last decade, structures of the small and large ribosomal subunits and of the intact ribosome have begun to reveal the molecular details of how the ribosome works. Both cryo-electron microscopy and X-ray crystallography continue to provide fresh insights into the mechanism of translation. In this review, we describe the most recent structural models of the bacterial ribosome that shed light on the movement of messenger RNA and transfer RNA on the ribosome after each peptide bond is formed, a process termed translocation. We also discuss recent structures that reveal the molecular basis for stop codon recognition during translation termination. Finally, we review recent advances in understanding how bacteria handle errors in both translocation and termination.
References
96
Referenced
88
10.1016/j.molcel.2008.10.001
10.1038/10695
10.1016/j.cell.2005.03.023
10.1186/1745-6150-1-28
10.1074/jbc.M710037200
10.1073/pnas.0607541103
10.1126/science.1175800
10.1038/nsmb831
10.1021/cb700100n
10.1002/j.1460-2075.1983.tb01591.x
10.1038/218675a0
10.1261/rna.1057908
10.1126/science.1057766
10.1016/j.str.2008.01.007
10.1074/jbc.M805943200
10.1016/j.molcel.2007.01.027
10.1038/nsmb.1469
10.1016/j.molcel.2008.05.004
10.1073/pnas.0813180106
10.1006/jmbi.2001.5310
10.1016/j.cell.2005.04.015
10.1038/nsmb1060
10.1016/0092-8674(77)90147-7
10.1038/nsmb1243
10.1073/pnas.0801308105
10.1016/j.molcel.2008.03.012
10.1038/35018597
10.1073/pnas.0708517104
10.1017/S135583829999043X
10.1016/S0092-8674(00)80690-X
10.1016/j.cell.2007.03.050
10.1126/science.1179709
10.1093/emboj/19.11.2710
10.1073/pnas.0700762104
10.1038/35003097
10.1016/j.jmb.2008.10.079
10.1016/j.molcel.2006.05.044
10.1073/pnas.0809587105
10.1146/annurev.micro.62.081307.162948
10.1038/nature02332
10.1038/nature01225
10.1038/nsmb1221
10.1093/emboj/19.4.741
10.1074/jbc.274.1.249
10.1073/pnas.0810953105
10.1016/j.cell.2006.08.032
10.1038/nature07115
10.1038/342142a0
10.1046/j.1365-2958.2003.03799.x
10.1016/j.str.2008.04.001
10.1016/j.molcel.2007.01.022
10.1016/j.tibs.2009.04.004
10.1016/S0014-5793(02)02330-X
10.1038/nature04735
10.1126/science.1060612
10.1016/S0092-8674(02)01086-3
10.1146/annurev.biochem.74.061903.155440
10.1016/j.molcel.2007.01.014
10.1016/j.cell.2005.09.039
10.1111/j.1365-2958.2009.06598.x
10.1016/j.cell.2006.09.037
10.1016/j.jmb.2006.01.038
10.1038/nature01224
10.1017/S003358350600429X
10.1016/j.ceb.2009.01.023
10.1073/pnas.97.10.5185
10.1261/rna.1592509
10.1038/nature04152
10.1126/science.1117230
10.1073/pnas.61.2.768
10.1007/BF02759621
10.1093/nar/29.19.3982
10.1126/science.1131127
10.1016/j.jmb.2008.07.004
10.1016/j.molcel.2007.09.007
10.1016/j.molcel.2006.11.025
10.1021/cb8002946
10.1007/s00018-008-8416-4
10.1016/S0092-8674(00)80667-4
10.1038/sj.emboj.7600102
10.1074/jbc.X109.001552
10.1038/nrm2352
10.1038/nsmb.1622
10.1016/j.cell.2004.11.042
10.1038/sj.emboj.7601677
10.1016/S0092-8674(03)00476-8
10.1073/pnas.0811370106
10.1126/science.1164840
10.1042/BST0320733
10.1016/j.molcel.2007.09.015
10.1146/annurev.micro.61.080706.093323
10.1093/nar/gkp519
10.1016/j.cell.2009.01.036
10.1038/nature07582
10.1016/S1097-2765(02)00691-3
10.1126/science.1175275
Dates
Type | When |
---|---|
Created | 15 years, 3 months ago (May 12, 2010, 6:28 p.m.) |
Deposited | 3 years, 10 months ago (Oct. 6, 2021, 3:21 p.m.) |
Indexed | 2 months, 1 week ago (June 25, 2025, 5:07 p.m.) |
Issued | 15 years, 5 months ago (April 1, 2010) |
Published | 15 years, 5 months ago (April 1, 2010) |
Published Print | 15 years, 5 months ago (April 1, 2010) |
@article{Dunkle_2010, title={Ribosome Structure and Dynamics During Translocation and Termination}, volume={39}, ISSN={1936-1238}, url={http://dx.doi.org/10.1146/annurev.biophys.37.032807.125954}, DOI={10.1146/annurev.biophys.37.032807.125954}, number={1}, journal={Annual Review of Biophysics}, publisher={Annual Reviews}, author={Dunkle, Jack A. and Cate, Jamie H.D.}, year={2010}, month=apr, pages={227–244} }